Die IGKB hat es sich zur Aufgabe gemacht, den Zustand des Bodensees laufend zu untersuchen. Die Ergebnisse werden alle zwei Jahre in den sogenannten Grüne Berichten mit den routinemäßigen Messergebnissen über den Zustand des Sees veröffentlicht.

Spezielle Fachthemen wiederum werden in unregelmäßigen Abständen in den sogenannten Blauen Berichten zusammengefasst. Hierbei handelt es sich zum Beispiel um Abschlussberichte von Forchungsvorhaben oder zeitlich begrenzte Datenerhebungen.

Weitere, den Gewässerschutz am Bodensee betreffende Publikationen sind auf der Seite Fachpublikationen aufgelistet.